Дипломатические отношения между Республикой Таджикистан и Республикой Молдова установлены 26 января 1993 года.
С момента установления дипломатических отношений двусторонние и многосторонние связи Таджикистана с Молдовой строились по параметрам, характерным для взаимоотношений бывших союзных республик в постсоветский период их развития.
В них присутствует дух взаимного доверия, близость позиций по отдельным международным и региональным проблемам, наблюдается постоянная поддержка инициатив друг друга в рамках региональных и международных организаций, а также взаимодействие и контакты разного уровня в рамках СНГ, что рассматривается как благоприятная основа для налаживания многопланового сотрудничества на двусторонней основе.
Приоритеты многосторонних контактов двух стран просматриваются в контексте общих задач, определяемых в рамках Содружества Независимых Государств, членами которого являются оба государства, таких как укрепление безопасности и стабильности на всем пространстве СНГ, содействие дальнейшему развитию торгово-экономических связей.
В ходе двусторонних встреч и во время официального визита Президента Республики Молдова в Таджикистан (5-7 ноября 2002г.) состоялся обстоятельный обмен мнениями по вопросам двусторонних отношений, актуальным проблемам регионального и международного характера, представляющим взаимный интерес.
По итогам визита были подписан ряд документов межгосударственного, межправительственного и межведомственного характера.
Важным координирующим элементом развития и углубления разностороннего сотрудничества является Межправительственная таджикско-молдавская Комиссия по торгово-экономическому и научно-техническому сотрудничеству, созданная в 2004 году.
10-11 декабря 2018 года в городе Кишиневе Республики Молдова состоялось третье заседание Межправительственной таджикско-молдавской комиссии по торгово-экономическому и научно-техническому сотрудничеству.
В ходе заседания был рассмотрен комплекс вопросов двустороннего сотрудничества в сфере экономики и торговли, инвестиции и поддержки малого и среднего бизнеса, охраны окружающей среды, регионального развития, архитектуры, градостроительства, здравоохранения, образования, науки, культуры, социальной защиты населения, молодежной политики, физической культуры и спорта, сельского хозяйства, энергетики, туризма и транспорта.
В целом, взаимоотношения с Молдовой базируются на близости позиций сторон по многим ключевым вопросам двусторонней повестки дня и международной и региональной проблематики.